一般来说，探索细胞信号通路往往意味着研究磷酸化，比如分析激酶活性，甚至副产物（如ADP）。在此，我们就来看看研究人员如何通过监控激酶活性来研究细胞信号通路。开发和生物技术中所使用的许多筛选都是生化分析，利用单个纯化或重组的激酶将底物磷酸化。据赛默飞世尔研发部门的副总监Kurt Vogel介绍，经典的工具要算时间分辨荧光共振能量转移（TR-FRET）分析，它们寻找不同条件下磷酸化活性的改变。在这个分析中，“底物通常是一个小的肽段，标有荧光基团。而磷酸化特异的抗体上标有另一个荧光基团。这样当抗体与磷酸化的肽段结合时，这两个荧光标记彼此接近，可以发生FRET。一旦确定了目标化合物，人们也可以进行反向筛选，也就是换一换，通过单个化合物来筛选不同的激酶。短信已成为现代社会中一个*的沟通渠道。在细胞中，磷酸化事件充当了这一渠道。大量相互连接的细胞信号通路依赖激酶（和磷酸酶）将关键信息传递给一系列信使，有时候甚至从膜结合的表面分子一路传递给转录因子。许多信使分子本身就是激酶，有若干个丝氨酸、苏氨酸和酪氨酸残基，能够可逆地接受无机磷（Pi）。检测它们的磷酸化状态，包括在状态下如何改变，或如何被小分子所改变，是药物筛选和基础研究中的核心一环。

不过人们希望了解细胞信号通路系统，以及它们如何受到不同因素的影响，今天我们还没有可靠的分析来测定细胞裂解液中特定激酶的活性，由于大部分肽段和蛋白质底物都是混杂的，它们能被各种内源性激酶磷酸化，因此你实际上同时测定了几种不同的蛋白激酶。